การรับรู้ระดับโมเลกุลเกี่ยวข้องกับวิธีที่ไวรัสทำปฏิกิริยากับตัวรับ

การรับรู้ระดับโมเลกุลเกี่ยวข้องกับวิธีที่ไวรัสทำปฏิกิริยากับตัวรับ ซึ่งจะทำการแปลงเอนไซม์ 2 และเป้าหมายอื่น ๆ ภายในเยื่อหุ้มเซลล์ของโฮสต์รูปแบบของ coronavirus นั้น Amaro คาดการณ์ว่าจะมีอะตอมประมาณ 200 ล้านอะตอมซึ่งเป็นภาระที่น่ากลัวเนื่องจากต้องมีการคำนวณปฏิสัมพันธ์ของแต่ละอะตอมกับอีกอะตอมวิธีการผสมผสานแบบผสมผสาน

เรากำลังพยายามรวมข้อมูลที่ความละเอียดที่แตกต่างกันเป็นรูปแบบหนึ่งที่สามารถจำลองได้ในศูนย์ความเป็นผู้นำ โดยทั่วไปเราเริ่มต้นด้วยส่วนประกอบแต่ละชิ้นซึ่งโครงสร้างของพวกมันได้รับการแก้ไขที่ความละเอียดระดับอะตอมหรือใกล้กับอะตอมเราได้ทำให้ส่วนประกอบเหล่านี้ทำงานและเข้าสู่สถานะที่เสถียรแล้วจากนั้นเราก็สามารถนำมันเข้าสู่ซองที่ใหญ่ขึ้น การจำลองที่มีโมเลกุลใกล้เคียง ห้องทดลองของอะมาโร่วิ่งจำลองพลวัตของโมเลกุลบนโหนดมากถึง 4,000 โหนดหรือแกนประมวลผลประมาณ 250,000 คอร์บน Frontera Frontera ซูเปอร์คอมพิวเตอร์อันดับ # 5 ของโลกและซุปเปอร์คอมพิวเตอร์อันดับ 1 ของโลก